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会议论文详细信息

基于Bias-exchange Metadynamics方法计算20种氨基酸及几个小肽的跨膜自由能       

文献类型:会议

作  者:曹赞霞 边运强 刘磊 赵立岭 王吉华

作者单位:山东省生物物理重点实验室,德州学院,中国山东德州,253023 物理与电子信息学院,德州学院,中国山东德州,253023 山东省生物物理重点实验室,德州学院,中国山东德州,253023 信息与管理学院,德州学院,中国山东德州,253023

会议文献:第十届全国软物质与生命物质物理学术会议论文集

会议名称:第十届全国软物质与生命物质物理学术会议

会议日期:20170300

会议地点:厦门

主办单位:中国物理学会;中国力学学会;中国化学会

出版日期:20170300

语  种:中文

摘  要:研究不同氨基酸从水到细胞膜的跨膜过程对理解细胞穿膜肽的穿膜机制及膜蛋白的热力学性质非常重要.第一部分工作,我们基于bias-exchange metadyanmics模拟方法研究20种氨基酸残基从水到DPPC细胞膜中心的跨膜过程.模拟共用了四个副本(前三个副本的反应坐标分别为氨基酸与下层膜质心的距离,氨基酸的二面角φ和 ψ,第四个副本未加任何偏置),高斯势的高度均为0.4kJ/mol,对三个反应坐标,高斯势的宽度分别为0.2nm、0.314和0.314.

关 键 词:分子动力学模拟  跨膜自由能  跨膜结构特征  

分 类 号:TH1[机械类] R56]

参考文献:

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同被引文献:

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