文献类型：会议

作　　者：李纯莲 王希诚 陆杰 赵金城

作者单位：大连理工大学电信学院计算机科学技术系,大连 116023 长春大学计算机科学与技术学院,130022 大连理工大学工业装备结构分析国家重点实验室,大连 116023 大连大学生物信息学与分子设计研究所,大连 116621

会议文献：第8届全国并行计算大会论文集

会议名称：第8届全国并行计算大会

会议日期：20040726

会议地点：辽宁大连

主办单位：全国并行计算委员会

出版日期：20040726

语　　种：中文

摘　　要：分子对接是计算机辅助药物分子设计(CAMD)中的一种重要方法，是大规模数据库筛选的理想途径。本文首先对分子对接理论进行了介绍，然后基于柔性配体分子与刚性受体分子的对接过程，建立一个数学规划模型，将分子对接中的构像搜索转化为求解约束极小化问题的过程，并采用带有空间收缩的小种群并行遗传算法进行求解。在分布式存储的并行机曙光3000上模拟计算表明,该设计具有很高的并行加速比,在保证分子对接的准确性和有效性的前提下,大大提高了分子构像搜索的速度。

关 键 词：药物设计 分子对接 分子构像  并行计算

分 类 号：R914.2] TP338.6[药学类]