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会议论文详细信息

茶多酚可能通过调节T细胞耗竭改善糖尿病肾病临床症状       

文献类型:会议

作  者:曹舒清 陈梦 张钰婧 焦博恒 张源远 郭晨洁

作者单位:[1]山西医科大学法医学院 [2]山西医科大学临床医学院 [3]山西医科大学公共卫生学院预防医学系

会议文献:Abstract Book of the 14th Asian Congress of Nutrition--Precision Nutrition

会议名称:第十四届亚洲营养大会

会议日期:20230914

会议地点:中国四川成都

出版日期:20230914

语  种:中文

摘  要:目的:T细胞耗竭相关研究广泛集中于肿瘤和感染性疾病,对于其是否参与代谢性疾病及其并发症发生发展尚不清楚。本文旨在通过生物信息学方法筛选可能影响糖尿病肾病(DN)发生发展的T细胞耗竭相关中枢基因,进行靶向天然活性成分筛选,为日常饮食添加天然活性成分补剂以达到防治DN的研究提供分子生物学依据。方法:从GEO数据库下载中国DN患者肾小管数据集GSE96804获取基因表达谱,利用ImmuCellAI进行免疫细胞浸润分析,利用WGCNA法构建DN基因共表达网络,选择与DN高度相关的模块,提取相关基因。通过Genecards数据库获取T细胞耗竭基因,两者关联获得DN相关T细胞耗竭基因,对其进行生物富集分析和蛋白质相互作用网络构建,通过Cytoscape软件的MCODE算法筛选功能模块基因。利用模块基因构建Lasso回归模型筛选中枢基因,绘制ROC曲线验证模型准确性。通过Nephroseq肾脏数据库验证DN患者血清肌酐清除率、肾小球滤过率与中枢基因表达相关性。通过KIT肾脏单细胞数据库进行表达分析验证。最后再通过CNKI、Pubmed、Web of Science和Cochrane等数据库全面检索筛选整理对免疫调节及DN防治有积极作用的可供膳食添加的天然活性成分,提取核心成分为有效成分,利用AutoDock Vina软件进行分子对接模拟验证和SwissADME药代动力学分析。结果:免疫细胞浸润分析发现,CD4 naive细胞、CD4T+细胞、CD8T+细胞、Tcm细胞、Tem细胞、iTreg细胞、nTreg细胞、Tfh细胞、Th1细胞、Th17细胞、Th2细胞等T细胞亚型在DN肾小管组织高度浸润,WGCNA分析发现brown模块和magenta模块与DN最为相关,且共获得36个交集基因为DN相关T细胞耗竭基因,富集分析显示其主要参与细胞氧化磷酸化、内源性细胞凋亡和IL12介导的信号通路等生物学过程,通过MCODE算法获取到8个核心功能模块基因,Lasso回归模型共识别出4个与DN发展发展关系密切的

关 键 词:T细胞耗竭  糖尿病肾病 表没食子儿茶素没食子酸酯 基因组学 日常膳食  

分 类 号:R587.2] R692.9]

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同被引文献:

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