文献类型：会议

作　　者：姚志斌 张劲松

作者单位：[1] 中国医科大学眼科医院 [2] 中国医科大学第四临床学院辽宁省晶状体重点实验室

会议文献：第九届全国中西医结合眼科学术交流会暨第八次东北亚国际眼科学术会论文汇编

会议名称：第九届全国中西医结合眼科学术交流会暨第八次东北亚国际眼科学术会

会议日期：20100731

会议地点：中国黑龙江哈尔滨

主办单位：中国中西医结合学会眼科专业委员会

出版日期：20100731

学会名称：中国中西医结合学会

语　　种：中文

摘　　要：目的观察和分析人的正常晶状体蛋白质组成。方法将完整的晶状体样品进行预分离后再通过十二烷基硫酸钠聚丙烯酰胺凝胶(1D SDS-PAGE)分离晶状体蛋白质、依照染色后的结果分成条带后进行胶内酶解,酶解后的肽段通过反相液相色谱再次分离,用线性离子阱串联质谱仪(LTQ)对洗脱出的肽段进行分析。得到的原始数据处理采用TurboSEQUEST算法筛选结果,利用反转库估计蛋白质组数据假阳性率。运用生物信息学方法分析鉴定出的蛋白质结果共鉴定出人的正常晶状体蛋白质及其亚基939个,根据两个或两个以上的独特的肽段蛋白质及其亚基鉴定的有214个,根据一个肽段鉴定的蛋白质及其亚基有725个,除鉴定出高丰度晶状体蛋白,还鉴定出许多低丰度蛋白。鉴定出342个蛋白亚基,其中锌指蛋白亚型19种,与泛素相关蛋白亚型6种,微管蛋白相关蛋白亚型8种,跨膜蛋白质相关蛋白亚型2种,14-3-3相关蛋白亚型5种,肌动蛋白相关蛋白亚型6种,CDNA FLJ相关蛋白亚型22种,膜联蛋白相关蛋白亚型6种,锚蛋白相关蛋白亚型3种,细胞色素相关蛋白亚型5种,T复合物相关蛋白亚型5种,信号传导相关蛋白亚型2种。一些蛋白尚不能完全确定,类似于某种蛋白有34种,不确定蛋白有49种,没有特征的蛋白有20个,已知分子量但不知功能蛋白有42个。通过生物信息学分析实验鉴定出的晶状体蛋白质数据,获得晶状体蛋白质功能分类和一些重要代谢过程的结果。结论本研究提供了大量的正常晶状体蛋白质数据及其相应功能的分析,为研究晶状体蛋白质生理和病理过程提供了新的思路。线性离子阱串联质谱法(LTQ)结合先进的生物信息学分析方法是鉴定和分析蛋白质的理想工具。

关 键 词：晶体蛋白质类 电泳,聚丙烯酰氨凝胶  反相高效液相色谱 质谱法 生物信息学  

分 类 号：R77]