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会议论文详细信息

Triticeae-GeneTribe:小麦族物种同源基因功能数据库       

文献类型:会议

作  者:宋皖君 陈永明 谢小明 彭惠茹 倪中福 孙其信 郭伟龙

作者单位:中国农业大学农学院/农业生物技术国家重点实验室/杂种优势研究与利用教育部重点实验室

会议文献:第十届全国小麦基因组学及分子育种大会摘要集

会议名称:第十届全国小麦基因组学及分子育种大会

会议日期:20190811

会议地点:中国山东烟台

出版日期:20190800

学会名称:中国作物学会

语  种:中文

摘  要:小麦族的物种基因组庞大且亲缘关系复杂。近年来,随着测序技术的快速发展和应用,小麦族基因组学迎来了突飞猛进的发展。目前为止,六倍体小麦Triticumaestivum (BBAADD)及其近缘种Triticum urartu(AA)、Aegilops tauschii(DD)和Triticum turgidum (BBAA)的基因组图谱均绘制完成,为研究和育种工作提供了重要参考。一些物种已经具有多个版本的参照基因组或基因注释。国际上正进行的"小麦泛基因组项目"(http://www.10wheatgenomes.com)也将为小麦领域的研究提供更多重要的参考序列。然而,小麦族不同物种、不同品种和不同版本的参照基因组间关系复杂,同源基因的查询及分析困难。现有通用的同源基因数据库无法满足小麦领域当前分析研究的需要。我们利用小麦族物种中当前已发表的10余个参照基因组,开发了针对小麦族的不同参照基因组间同源基因鉴定的层级化分析流程,构建了小麦族同源基因数据库。同时,我们搭建了小麦族同源基因在线分析平台Triticeae-GeneTribe (TGT,http://wheat.cau.edu.cn/TGT/),支持小麦族各物种、各基因组版本的"同源基因查询"、"基因功能查询"、"Gene Ontology富集分析"和"局部区间基因共线性分析"等功能。本研究将会为小麦族各物种的基因功能挖掘和分子育种提供参考。

关 键 词:小麦族 同源基因 GO分析  共线性 数据库

分 类 号:S512.1]

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同被引文献:

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