会议论文详细信息
文献类型:会议
作者单位:[1]中国医学科学院北京协和医学院肿瘤医院病因及癌变研究室 [2]中国医学科学院北京协和医学院肿瘤医院腔镜科
会议文献:全国肿瘤流行病学和肿瘤病因学学术会议论文集
会议名称:全国肿瘤流行病学和肿瘤病因学学术会议
会议日期:20150819
会议地点:中国四川成都
主办单位:中国抗癌协会肿瘤病因学专业委员会;中国抗癌协会肿瘤流行病学专业委员会;中华医学会中华预防医学杂志编委会
出版日期:20150819
学会名称:中国抗癌协会
语 种:中文
摘 要:目的:通过分析鼻咽癌患者的肿瘤和癌旁组织的microRNA(miRNA)表达谱,筛选与鼻咽癌发生机制以及临床生物学行为相关的miRNA。方法:采用Agilent Human microRNA Microarray(8 x 15K),对经鼻咽镜活检取得的20例鼻咽癌患者的肿瘤及癌旁组织的RNA样品进行杂交检测;对基因芯片数据进行生物信息学分析,筛选有意义的miRNA;进而使用5个数据库(DIANAmT、miRanda、miRDB、PICTAR5和Targetscan)预测相应靶基因,并以3个数据库(mirWalk、miRTarBase和TarBase)对所得到的靶基因进行生物信息学验证。结果:microRNA芯片分析,筛选得到78个在肿瘤组织与癌旁组织之间差异表达的miRNA(筛选标准:P value<0.05且Fold Change>2.0);对其靶基因的功能进行GO富集分析,发现靶基因功能主要涉及WNT、Angiogenesis、FGF、EGFR.等信号通路。而在对放射治疗敏感和不敏感的鼻咽癌组织两组之间,得到41个差异表达miRNA(筛选标准:Pvalue<0.05且Fold Change>2.O);通过非监督聚类分析,发现此41个miRNA可以很好地区分放疗高敏感组和放疗低敏感组;对其靶基因的功能进行GO富集分析,显示靶基因功能主要涉及Angiogenesis、Integrin、P13K、IGF、TGF-beta、WNT等信号通路。通过SVM算法构建由其中8个miRNA组成的数学模型来评估鼻咽癌的放疗敏感性,初步实验显示,其评估准确性可达100%。结论:鼻咽癌患者的肿瘤与癌旁组织的miRNA表达谱存在显著差异,为研究鼻咽癌发生的分子机制提供了线索;而在不同放疗敏感性的鼻咽癌组织之间的差异表达miRNA,则有可能作为评估预测鼻咽癌放疗敏感性的候选分子标志物。
分 类 号:R739.63]
参考文献:
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耦合文献:
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引证文献:
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同被引文献:
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