会议论文详细信息
文献类型:会议
作者单位:成都中医药大学药学院中药资源系统研究与开发利用省部共建国家重点实验室培育基地
基 金:广元川产道地药材天麻杜仲规范化种植与精深加工技术集成示范(313-877);中药资源四川省青年科技创新研究团队(319-630)
会议文献:2017第五届全国天麻会议暨中国(小草坝)天麻产业发展高峰论坛论文集
会议名称:2017第五届全国天麻会议暨中国(小草坝)天麻产业发展高峰论坛
会议日期:20171021
会议地点:中国云南彝良
主办单位:中国菌物学会;中国医学科学院药用植物研究所
出版日期:20171000
学会名称:中国菌物学会
语 种:中文
摘 要:目的:对天麻进行转录组学分析,从转录组水平阐释天麻次级代谢产物含量与相关酶活性关系。方法:采用Illumina Hiseq 4000对新鲜天麻及采后敞放5天天麻进行转录组测序分析,通过与基因数据库比对分析注释和发现差异表达基因。结果:新鲜天麻及采后敞放5天天麻分别获得了18772600、19353329条Clean Reads,Trinity组装后得到63455条Unigene,通过与NR、Swiss-Prot、GO、COG、KOG、KEGG数据库比对,最终获得18913个有注释信息的Unigene。天麻采收放置5天后有953个基因转录表达量上升,1876个基因转录表达量下降,合计2829个差异表达基因。634条差异表达基因被COG注释到的25个功能类别中,612条差异性表达基因被KEGG注释归属于50条代谢通路。天麻转录组差异表达数据中共11个关键基因被KEGG数据库苯丙烷类合成途径注释,与新鲜天麻相比,放置5天的天麻CM、PDT、PAL、4CL、CHS、F5H、F3’M基因表达量下降,C4H、CCR表达量上升,CAD表达量既有上升又有下降。结论:本研究第一次获得了较完整的天麻苯丙烷类产物合成代谢通路图,并注释了大量相关基因序列。通过本研究为后续深入的基因功能研究及天麻药材品质形成的分子机理研究、天麻栽培过程的质量控制以及采收后的保鲜处理等奠定了一定的参考依据。
关 键 词:天麻 转录组 差异表达基因 苯丙烷类代谢
分 类 号:S567.239]
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引证文献:
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