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会议论文详细信息

垂穗披碱草MADS-box基因WM8克隆及分析       

文献类型:会议

作  者:张妙青 张吉宇 刘志鹏 王彦荣 张磊

作者单位:兰州大学草地农业科技学院/农业部草地农业生态系统学重点开放实验室

基  金:国家“973”课题(2007CB108904);兰州大学中央高校基本科研费专项基金(lzujbky-2009-108,lzujbky-2009-4);“十一五”国家科技支撑计划(2008BADB3B03-4)共同资助

会议文献:第二届全国种子科学与技术学术研讨会论文摘要集

会议名称:第二届全国种子科学与技术学术研讨会

会议日期:20110513

会议地点:中国湖南长沙

主办单位:中国植物学会种子科学与技术专业委员会

出版日期:20110513

学会名称:中国植物学会

语  种:中文

摘  要:垂穗披碱草(Elymus nutans)是我国西北地区广泛栽培的优良牧草。对垂穗披碱草中MADS-box基因的研究,不仅有助于阐明其控制花发育的分子机制,具有潜在的种子生产价值,而且作为麦类作物的野生近缘种遗传资源,对于丰富麦类作物遗传多样性的基因资源库具有重要的经济利用价值。本研究以室内栽培的苗期垂穗披碱草的幼嫩叶片为材料,PrimerPremier5.0设计引物,通过RT-PCR的方法获得了MADS-box基因家族的EnWM8基因cDNA全长序列,利用DNAMAN6.0对其进行了序列翻译、多重比对以及同源树分析,NCBI进行Blast检索,ProtParam、TMHMM2.0Serve、Expasy等生物信息学分析软件对WM8蛋白的结构进行了分析。结果显示:1)从垂穗披碱草中获得了WM8基因的全长cDNA序列,命名为EnWM8(Genbank登录号为JF683846)。序列分析表明,该cDNA全长1196bp,开放阅读框共编码275个氨基酸,具有典型的MADS-box结构域以及半保守的K区,是MIKC型MADS-box基因,分析认为其与花发育和果实成熟等有关。2)EnWM8与小麦的WM8、AGL29和fruitful-like基因氨基酸的推导序列的相似性分别高达95.62%、96.72%和96.28%。采用DNAMAN软件进行系统进化树分析显示,该基因与小麦的TaWM8进化关系最近,与拟南芥的AtWM8、AtGL29较远。3)垂穗披碱草WM8蛋白主链由275个氨基酸组成,为亲水性的碱性蛋白,无跨膜结构域,主要定位于细胞核中,其空间结构主要由α-螺旋、无规则卷曲和延伸链结构构成。

分 类 号:S543.9]

参考文献:

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二级参考文献:

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耦合文献:

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引证文献:

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二级引证文献:

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同被引文献:

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