会议论文详细信息
文献类型:会议
作者单位:福建医科大学公共卫生学院,环境与健康研究所毒理学与化学物安全性评价研究室 福州,350108
会议名称:中国毒理学会生化与分子毒理专业委员会学术会议暨环境内分泌干扰物的毒理学研究新技术新方法研讨会
会议日期:20141028
会议地点:深圳
主办单位:中国毒理学会生化与分子毒理专业委员会;深圳市疾病预防防控中心
出版日期:20141028
语 种:中文
摘 要:目的:前期研究结果表明,反式转录因子Nrf2在环境化学物致神经退行性病变中发挥重要作用,本研究应用Nrf2基因敲除小鼠探讨反式转录因子Nrf2相关的miRNA、lncRNA、mRNA表达谱的变化情况,并预测其可能涉及的作用及信号通路,进而探讨反式转录因子Nrf2与miRNA、lncRNA表达谱之间的关系,为进一步研究反式转录因子Nrf2与非编码RNA在环境化学物致神经退行性病变的作用提供基础数据.方法:(1)取Nrf2(+/+)和Nrf2(-/-)ICR小鼠(n=3)中脑黑质组织进行miRNA、lncRNA和mRNA芯片检测,并通过Volcano Plot过滤,确定差异表达的miRNA(差异倍数(FC)≥1.3且p<0.05),lncRNA(FC≥ 1.5且p<0.05),mRNA(FC≥1.5且p<0.05).(2)对差异表达的mRNA进行基因本体(GO)分析和KEGG通路分析.(3)用锁定核苷酸原位杂交(LNA-ISH)和荧光定量RT-PCR(qRT-PCR)验证miRNA-380-3p,qRT-PCR验证特异lncRNA(NR-030777、uc007nsi.1、AK047865、NR-027648、NR-024257)表达水平(n=3).(4)用CNC相关分析预测特异LncRNA的靶基因,并对其下游靶基因进行GO分析和KEGG通路分析. 结果:(1)与Nrf2(+/+)小鼠相比,Nrf2(-/-)小鼠中有8个miRNA表达谱发生显著改变,其中mmu-miR-128表达下调,mmu-miR-669c、mmu-miR-298、mmu-miR-543 、 mmu-miR-770-5p 、mmu-miR-669b* 、 mmu-miR-7a、mmu-miR-544-5p表达上调;有344个lncRNA表达发生显著改变,其中226个lncRNA表达下调,118个lncRNA表达上调;有202个mRNA的表达发生了显著改变,其中129个mRNA表达下调,73个mRNA表达上调.(2)差异表达的miRNA,lncRNA和mRNA有层次聚类分析的表达模式.(3)mRNA差异表达谱GO分析结果:上调的mRNA参与有丝分裂、核分裂、细胞器裂变等生物学过程,涉及细胞骨架、角蛋白、蛋白复合物等细胞成分,组蛋白激酶活性、结构分子活性、蛋白激酶活性等分子功能;下调的mRNA参与肾小球血管系统的形成、细胞因子刺激应答等生物学过程,涉及胞外区、中心粒等细胞成分,酶抑制�
分 类 号:R39[基础医学类] R73[临床医学类]
参考文献:
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引证文献:
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