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会议论文详细信息

芸薹属物种中嵌合型LTR反转座子分析       

文献类型:会议

作  者:魏丽娟 肖美丽 安泽山 马赑 Annaliese S.Mason 钱伟 李加纳 付东辉

作者单位:西南大学农学与生物科技学院,重庆油菜工程研究中心,重庆,400716 豆科植物研究中心,农业与食品科学学院,昆士兰大学,澳大利亚,布里斯班,4072 江西农业大学农学院,教育部作物生理生态与遗传育种重点实验室,江西南昌,330045

会议文献:中国作物学会油料作物专业委员会第七次会员代表大会暨学术年会论文集

会议名称:中国作物学会油料作物专业委员会第七次会员代表大会暨学术年会

会议日期:20131101

会议地点:海南文昌

主办单位:中国作物学会

出版日期:20131100

语  种:中文

摘  要:真核生物基因组中LTR反转座子是最重要的转座子类型,它通过大量复制改变基因的功能或重构基因组.有些LTR反转座子偏爱性地插入到其它的LTR反转座子中,但组成这些嵌合型转座子的原因和进化意义尚不清楚.本研究中,我们从1.52Gb的芸薹属序列中,寻找到6个高度富集LTR转座子的BAC.其中,4个BAC的LTR转座子形成主要是自我复制,少数来源于外源转座子的插入.通过Genescan软件分析,共预测到207个基因,转座子插入到基因中,使大多数基因失活.另外,丰富的SSR存在于LTR-TEs区域内,5个BAC被推测为位于异染色质区域,SSR和LTR转座子在着丝粒的形成过程中起着重要的作用.结论:LTR转座子自我复制,重复插入,抑制基因的活性,并形成着丝粒区域.

关 键 词:LTR反转座子  芸薹属 着丝粒 转座子富集  转座子爆发  

分 类 号:S43] S56

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引证文献:

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同被引文献:

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