文献类型：期刊文章

作　　者：王小彤[1] 李文豪[2] 林枫[1] 江守文[2] 翟万营[2] 吴智超[2] 许强华[1,3,4]

Wang Xiaotong;Li Wenhao;Lin Feng;Jiang Shouwen;Zhai Wanying;Wu Zhichao;Xu Qianghua(Key Laboratory of Ministry of Education for Sustainable Exploitation of Oceanic,College of Marine Sciences,Shanghai Ocean University,Shanghai,201306;Key Laboratory of Ministry of Education for Aquaculture Resources and Utilization,Shanghai Ocean University,Shanghai,201306;National Distant-water Fisheries Engineering Research Center,Shanghai,201306;Collaborative Innovation Center for Distant-water Fisheries,Shanghai,201306)

机构地区：[1]上海海洋大学海洋科学学院,大洋渔业资源可持续开发教育部重点实验室,上海201306 [2]上海海洋大学,水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室,上海201306 [3]国家远洋渔业工程技术研究中心,上海201306 [4]远洋渔业协同创新中心,上海201306

出　　处：《基因组学与应用生物学》

基　　金：国家重点研发计划项目(2018YFD0900601);国家自然科学基金国际合作项目(41761134050);国家自然科学基金面上项目(31772826);上海市教委重点科技创新项目(2017-01-07-00-10-E00060)共同资助

年　　份：2021

卷　　号：40

期　　号：7

起止页码：2574-2582

语　　种：中文

收录情况：AJ、BDHX、BDHX2020、CAB、CAS、CSCD、CSCD2021_2022、JST、WOS、ZGKJHX、核心刊

摘　　要：为探究血红蛋白缺失对免疫功能造成的影响,针对一种缺乏血红蛋白和功能性血红细胞的南极独角雪冰鱼(Chionodraco hamatus)和3种具有血红蛋白和血红细胞的南极鱼物种(伯氏肩孔南极鱼(Trematomus bernacchii)、博氏南冰■(Pagothenia borchgrevinki)和革首南极鱼(Notothenia coriiceps))的鳃组织进行转录组测序比较研究。结果表明:在参与比较的7498个基因中,2796个基因在南极冰鱼鳃中呈显著变化,其中,1584个基因在南极冰鱼鳃组织中的表达量显著降低,1212个基因表达量显著上升。差异基因的KEGG Pathway富集分析显示,33条与免疫和低氧相关的通路(如HIF-1信号通路)在南极冰鱼鳃中得到了富集。差异基因的GO富集分析也揭示出南极冰鱼在与免疫功能和红细胞发生相关的多个生物过程GO通路中(如免疫系统发育、稳态过程和造血或淋巴器官发育等)发生了富集。值得一提的是,在南极冰鱼鳃中表达量下降的基因(如gata1a,tfr1a,kmt2a,slc4a1a,myb,alas2,epor,slc25a37和metap2a等)中许多都与免疫功能和红细胞发生相关,这与南极冰鱼血红细胞发生受抑制相一致。可见,独角雪冰鱼与其他三种南极鱼鳃组织在免疫方面基因的表达差异显著,为揭示南极鱼类免疫机制的进化提供了参考资料。

关 键 词：南极鱼  鳃  转录组分析  免疫

分 类 号：S917.4[水产类]