文献类型：期刊文章

作　　者：王历[1] 朱先玉[1] 杨家磊[1] 王文君[1] 蔺艳[1] 杨茂[1] 杨文理[1,2]

Wang Li;Zhu Xianyu;Yang Jialei;Wang Wenjun;Lin Yan;Yang Mao;Yang Wenli(Institute for Cancer Medicine,School of Basic Medical Sciences,Southwest Medical University,Luzhou,646000;Department of Biochemistry and Molecular Biology,School of Basic Medical Sciences,Southwest Medical University,Luzhou,64600)

机构地区：[1]西南医科大学基础医学院肿瘤医学研究所,泸州646000 [2]西南医科大学基础医学院生物化学与分子生物学教研室,泸州646000

出　　处：《基因组学与应用生物学》

基　　金：四川省科学技术厅国际科技创新合作项目(2020YFH0121)资助

年　　份：2022

卷　　号：41

期　　号：2

起止页码：435-444

语　　种：中文

收录情况：AJ、BDHX、BDHX2020、CAB、CAS、CSCD、CSCD2021_2022、JST、WOS、ZGKJHX、核心刊

摘　　要：人TAGLN基因编码的蛋白参与细胞骨架重构,在肿瘤细胞的增殖、迁移、侵袭和转移等生物学过程发挥重要作用。为探究TAGLN基因的启动子区、CpG岛、转录因子结合位点、翻译后修饰位点、亚细胞定位及B细胞线性表位,利用多种生物信息学方法在线分析TAGLN基因5′端的启动子、CpG岛、转录因子结合位点、翻译后修饰位点和亚细胞定位及B细胞线性表位。结果表明,Promoter 2.0未显示明显的启动子序列;其余3种软件显示人TAGLN基因5′调控区2000 bp含启动子序列,但核心启动子区不同且对应不同的转录本;4种软件均未发现CpG岛,但均显示有一处CpG集中分布区域;AliBaba2.1和PROMO数据库预测与TAGLN基因启动子区的共同转录因子结合位点17个;JASPAR获得6个与转录方向一致(正链)的转录因子;SwissRegulon显示第1个启动子结合的转录因子JUNB、SMAD4、SMAD1和SMAD3与转录方向一致;人TAGLN基因编码的蛋白主要定位于细胞质和细胞核,可被磷酸化、乙酰化、泛素化和甲基化等翻译后修饰调控,有9个B细胞线性表位(抗原表位)热点片段。生物信息学软件能预测人TAGLN基因的启动子区、CpG岛、转录因子结合位点、翻译后修饰位点、亚细胞定位及B细胞线性表位,可以高效地获得TAGLN基因的相关信息,为深入研究该基因对乳腺癌的影响及作用机制和抗体开发等提供理论依据。

关 键 词：TAGLN基因  启动子 生物信息学 翻译后修饰 肌动蛋白结合蛋白 乳腺癌  

分 类 号：Q811.4[生物工程类]