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期刊文章详细信息

微孢子感染东亚飞蝗实时定量PCR内参基因的筛选    

Identification of stable reference genes for real-time quantitative PCR(RT-qPCR) in Locusta migratoria infected by Paranosema locustae

  

文献类型:期刊文章

作  者:魏笑佳[1] 何岚[1] 阿地拉·阿吉[1] 季荣[1] 扈鸿霞[1]

WEI Xiao-Jia;HE Lan;ADILA·Aji;JI Rong;HU Hong-Xia(International Center for the Collaborative Management of Cross-border Pest in Central Asia,College of Life Sciences,Xinjiang Normal University,Urumqi 830054,China)

机构地区:[1]新疆师范大学生命科学学院,中亚区域跨境有害生物联合控制国际研究中心,乌鲁木齐830054

出  处:《应用昆虫学报》

基  金:新疆维吾尔自治区高校科研计划项目(XJEDU2017S030);新疆维吾尔自治区天山青年计划青年博士科技人才培养项目(2017Q082);新疆师范大学校级教学研究与改革项目(SDJG2019-15)

年  份:2021

期  号:1

起止页码:108-116

语  种:中文

收录情况:AJ、BDHX、BDHX2020、CAB、CAS、CSCD、CSCD2021_2022、JST、RCCSE、WOS、ZGKJHX、核心刊

摘  要:【目的】筛选出微孢子Paranosema locustae感染条件下东亚飞蝗Locusta migratoria实时定量PCR最适内参基因。【方法】本研究应用实时荧光定量PCR技术测定东亚飞蝗甘油醛-3-磷酸脱氢酶基因(Glyceralde-hyde-3-phosphate dehydrogenase,GAPDH)、18s核糖体RNA(18s RNA)、微管蛋白基因(Tubulin,TUB)、肌动蛋白基因(Actin,ACT)和延伸因子1基因(Elongation factor1,EF1)5个候选基因在3个微孢子浓度(1×10^(4)、1×10^(6)和1×10^(8)个孢子/头)感染12 d后的表达稳定性;应用ge Norm、Bestkeeper和Normfinder 3个软件综合分析5个内参基因的稳定性。【结果】ge Norm软件对5个内参基因在不同微孢子虫浓度感染下稳定性分析结果表明:18S基因稳定性最低,平均表达稳定性值M值最高为0.6584,TUB基因稳定性最高,M值最低为0.2784。Norm Finder软件分析在不同微孢子虫浓度感染下的5个内参基因的稳定值分别为0.152(EF1)、0.181(ACT)、0.212(TUB)、0.329(GAPDH)和0.395(18S),可知内参基因稳定性顺序为:EF1>ACT>TUB>GAPDH>18S。由Best Keeper软件分析表明5个候选内参基因的SD值均小于1.0,表达均较稳定。根据其变异系数值CV的大小可知,ACT基因最为稳定。【结论】综合3种软件分析结果,在不同微孢子虫浓度感染下,可选择的较为稳定的内参基因ACT、EF1和TUB基因作为相对定量的参照基因。

关 键 词:微孢子 东亚飞蝗 内参基因 实时定量PCR 表达稳定性  

分 类 号:S433.2]

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