文献类型：期刊文章

作　　者：陈丽香[1] 王刚[1] 韦吴迪[1,2] 蒋俊俊[1,2] 包秀丽[1] 梁浩[1,2] 叶力[1,2]

CHEN Lixiang;WANG Gang;WEI Wudi;JIANG Junjun;BAO Xiuli;LIANG Hao;YE Li(School of Public Health,Guangxi Medical University,Key Laboratory of AIDS Prevention and Control Research,Guangxi,Nanning,Guangxi 530021,China;Institute of Life Sciences,Guangxi Medical University,Guangxi Biomedical Collaborative Innovation Center,Nanning,Guangxi 530021,China)

机构地区：[1]广西医科大学公共卫生学院,广西艾滋病防治研究重点实验室,广西南宁530021 [2]广西医科大学生命科学研究院,广西生物医药协同创新中心,广西南宁530021

出　　处：《热带医学杂志》

基　　金：广西八桂青年学者项目(蒋俊俊);广西医科大学杰出青年基金(蒋俊俊)

年　　份：2023

卷　　号：23

期　　号：3

起止页码：401-405

语　　种：中文

收录情况：CAB、CAS、RCCSE、UPD、WOS、ZGKJHX、普通刊

摘　　要：目的分析中国内地不同省市新型冠状病毒(SARS-CoV-2)Omicron变异株的流行趋势、传播网络及进化关系。方法从全球疫情服务抗役互助平台、国家及不同省份卫生健康委员会官网收集2021年12月9日-2022年1月15日公布的Omicron病例流调数据,通过文本挖掘等手段获取传播关系等信息,并绘制疫情病例数热图;利用cytoscape软件绘制传播网络图;从GISAID和NCBI下载病毒序列绘制系统进化树。结果2021年12月9日-2022年1月15日,中国内地12个省市确诊34例Omicron病例,初始Omicron病例主要集中在广东(16例,占47.06%)、上海(5例,占14.71%)、天津(4例,占11.76%)。绘制2021年12月9日-2022年1月15日中国内地31个省市累计及新增新型冠状病毒肺炎(COVID-19)病例数热图,发现除了陕西省以外,COVID-19疫情分布与Omicron变异株疫情分布基本一致(陕西省在2021年12月24日病例快速增加,与Omicron变异株疫情分布不一致,可能是该地区德尔塔变异株占主导)。Omicron变异株聚集性传播明显,且存在跨省市传播现象。该变异株在中国地区存在多个小的聚类,聚集关系相对分散。广东1例与澳大利亚(Omicron-australia-01、Omicron-australia-02、Omicron-australia-03、Omicron-australia-04)聚类;浙江3例与加拿大(Omicron-canada-01)聚类;天津1例与波兰(Omicron-poland-02)聚类;浙江2例与加拿大(Omicron-canada-02)聚类。结论中国内地Omicron变异株与多个国家基因距离近,系统进化关系复杂,不同省市之间存在明显传播关系,全国COVID-19新增病例趋势和Omicron分布趋势基本一致,疫情传播凶险,应加强境外输入管控力度,并加强本土聚集性传播和跨省市传播管控力度,打好疫情防疫攻坚战。

关 键 词：新型冠状病毒 Omicron  流行特征  传播关系  系统进化

分 类 号：R563.1]