文献类型：期刊文章

作　　者：江红霞[1] 刘慧芬[1] 马晓[1] 吴利敏[1] 孔祥会[1] 李学军[1]

JIANG Hongxia;LIU Huifen;MA Xiao;WU Limin;KONG Xianghui;LI Xuejun(Engineering Lab of Henan Province for Aquatic Animal Disease Control,Engineering Technology Research Center of Henan Province for Aquatic Animal Cultivation,College of Fisheries,Henan Normal University,Xinxiang 453007,China)

机构地区：[1]河南师范大学,水产学院水产动物疾病控制河南省工程实验室,河南省水产动物养殖工程技术研究中心,河南新乡453007

出　　处：《水产学报》

基　　金：国家自然科学基金(31972812);河南省重点科技攻关项目(192102110081);河南师范大学博士科研启动费支持项目(qd17142);河南师范大学个人科研项目结余经费资助专项(20180531)

年　　份：2021

卷　　号：45

期　　号：3

起止页码：396-414

语　　种：中文

收录情况：AJ、BDHX、BDHX2020、CAB、CAS、CSCD、CSCD2021_2022、IC、JST、PROQUEST、RCCSE、SCOPUS、WOS、ZGKJHX、核心刊

摘　　要：为发掘克氏原螯虾卵巢发育、免疫和肌肉生长的重要功能基因,采用Illumina HiSeqTM 2500高通量测序平台对克氏原螯虾的卵巢、肝胰腺和肌肉组织进行了转录组测序。所得序列经质控、组装后比对到NR、Swiss-Prot、pfam、COG、GO和KEGG数据库中注释,并进行差异基因聚类分析。结果显示,测序共获得了53006个unigene,平均长度为1194 bp。对3个组织样品的测序文库进行两两比较,发现在卵巢vs.肝胰腺中有差异表达基因(differentially expressed gene,DEG)20382个,在肝胰腺vs.肌肉中有DEG 12753个,在肌肉vs.卵巢中有DEG 21629个。GO功能分类分析发现,部分DEG被注释到繁殖(reproduction)、繁殖过程(reproduction process)、免疫系统过程(immune system process)和生长(growth)GO条目。KEGG pathway分析显示,一部分DEG在卵巢发育、免疫和肌肉生长相关的信号通路中得到了富集。根据GO功能分类和KEGG信号通路分析筛选出了大量与克氏原螯虾卵巢发育、免疫和肌肉生长相关的候选基因,如卵黄蛋白原、卵黄蛋白原受体、Toll样受体2、Toll样受体相互作用蛋白、肌肉生长抑制素和5-羟色胺受体等。本研究结果丰富了克氏原螯虾的基因资源,可为克氏原螯虾的遗传育种和免疫研究提供基础数据。

关 键 词：克氏原螯虾 转录组测序 差异表达基因 功能注释

分 类 号：S917.4[水产类]