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基于网络药理学和分子对接技术初步探索“清肺排毒汤”抗新型冠状病毒肺炎作用机制
Preliminary exploration of the mechanism of Qingfei Paidu decoction against novel coronavirus pneumonia based on network pharmacology and molecular docking technology
文献类型:期刊文章
WU Hao;WANG Jia-qi;YANG Yu-wei;LI Tian-yi;CAO Yi-jia;QU Yu-xia;JIN Yu-jie;ZHANG Chen-ning;SUN Yi-kun(School of Chinese Materia Medica,Beijing University of Chinese Medicine,Beijing 102488,China;Taihe Hospital,Hubei University of Medicine,Shiyan 442000,China)
机构地区:[1]北京中医药大学中药学院,北京102488 [2]十堰市太和医院,湖北医药学院附属医院,湖北十堰442000
基 金:十堰市科技局指导项目(19Y30).
年 份:2020
卷 号:55
期 号:3
起止页码:374-383
语 种:中文
收录情况:AJ、BDHX、BDHX2017、CAB、CAS、CSCD、CSCD2019_2020、EMBASE、IC、IPA、JST、PUBMED、RCCSE、RSC、SCOPUS、WOS、ZGKJHX、核心刊
摘 要:利用中药网络药理学和分子对接技术初步探索"清肺排毒汤"抗新型冠状病毒肺炎(coronavirus disease2019,COVID-19)作用机制。结合中国药典(2015版)以及中药系统药理学数据库及分析平台(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology,TCMSP)、OMIM(Online Mendelian Inheritance in Man)、GeneCard、STRING等在线数据库,进行一系列网络构建、核心靶点筛选以及信号通路富集分析,最后对重要化合物进行分子对接预测。结果发现,清肺排毒汤化合物-肺炎靶点网络包含292个化合物和相应靶点214个,核心靶点涉及AKT1(AKT serine/threonine kinase 1)、IL6(interleukin 6)、MAPK8(mitogen-activated protein kinase 8)、MAPK1(mitogen-activated protein kinase 1)和JUN(jun proto-oncogene)等。应用GO(Gene Ontology)数据库功能富集分析得到858个GO条目,应用KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)数据库富集筛选得到122条有关通路,其中包含低氧诱导因子-1(hypoxia inducible factor-1,HIF-1)通路、Toll样受体(Toll-like receptors,TLRs)通路等已报道与肺炎相关的通路,也包括T细胞受体(T-cell receptor,TCR)通路等与肺损伤保护相关的通路。分子对接结果显示,清肺排毒汤中药材部分核心化合物对新型冠状病毒(2019-nCoV)的3C类似蛋白酶(3C-like protease,3CLpro)和血管紧张素转换酶2(angiotensin-converting enzyme 2,ACE2)蛋白具有一定的亲和力。本文初步探索了清肺排毒汤抗COVID-19的作用机制,且预测了其药效物质基础,期待本结果能为进一步确证清肺排毒汤抗COVID-19有效成分和作用机制提供帮助。
关 键 词:新型冠状病毒肺炎 清肺排毒汤 网络药理学 分子对接技术 机制初探
分 类 号:R285[中药学类]
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