文献类型：期刊文章

作　　者：邓雯文[1,2] 李玥[2] 李静[2] 朱文[1] 张乐[1] 邹立扣[2] 赵珂[2] 李倜[1]

DENG Wenwen;LI Yue;LI Jing;ZHU Wen;ZHANG Le;ZOU Likou;ZHAO Ke;LI Ti(State Forestry and Grassland Administration Key Laboratory of Giant Pandas,China Conservation and Research Centre of the Giant Panda,Chengdu 610051,China;Department of Applied Microbiology,College of Resources,Sichuan Agricultural University,Chengdu 611130,China)

机构地区：[1]中国大熊猫保护研究中心,国家林业和草原局大熊猫重点实验室,成都610051 [2]四川农业大学资源学院应用微生物学系,成都611130

出　　处：《应用与环境生物学报》

基　　金：中国大熊猫保护研究中心“2018科研年”项目(CCRCGP 181911);“2022科研年”项目(CCRCGP 222326)资助

年　　份：2023

卷　　号：29

期　　号：6

起止页码：1467-1475

语　　种：中文

收录情况：AJ、BDHX、BDHX2020、CAS、CSCD、CSCD2023_2024、JST、RCCSE、SCOPUS、WOS、ZGKJHX、核心刊

摘　　要：以圈养成年大熊猫的粪便为研究对象,采用高通量测序技术和可培养方法,研究圈养大熊猫肠道放线菌种群结构、组成及纤维素降解的功能特性.高通量测序结果显示,在属水平上放线菌属(Actinomyces)(15.52%)、微杆菌属(Microbacterium)(7.06%)、罗氏菌属(Rothia)(6.62%)、分枝杆菌属(Mycobacterium)(5.70%)和棒状杆菌科未鉴定属(unidentified_Corynebacteriaceae)(4.47%)相对丰度较高,性别对成年大熊猫放线菌菌群丰度无显著影响.PCoA分析显示成年大熊猫肠道优势放线菌的种群组成受个体差异的影响较大.Tax4Fun功能预测表明,大熊猫粪便中放线菌功能主要涉及碳水化合物代谢,具有与半纤维素、纤维素代谢相关酶的编码基因.采用2种预处理方法结合4种不同种类的分离培养基从大熊猫粪便中分离放线菌菌株,结果表明采用苯酚对样品进行前处理和分别添加50μg/mL重铬酸钾和制霉菌素的改良高氏一号培养基,分离放线菌的数量及种类最多.通过可培养方法共分离获得96株放线菌,分属于链霉菌属(Streptomyces)、拟无枝菌酸属(Amycolatopsis)、红球菌属(Rhodococcus)、微杆菌属(Microbacterium)、节杆菌属(Arthrobacter)5个属,且上述菌属均在高通量测序中被检测到.功能特性分析结果表明有15株菌株具有纤维素降解酶活性,以链霉菌属为主,且各菌株的β-葡萄糖苷酶(BGL)和外切葡聚糖酶(CBH)酶活较高.本研究表明圈养成年大熊猫肠道中放线菌不仅种类丰富,且部分放线菌具有纤维素降解潜力.

关 键 词：大熊猫 肠道放线菌  高通量测序  可培养分离  功能特性

分 类 号：S852.61]