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四种短体线虫的形态和分子生物学鉴定
Morphological identification and molecular characteristics and phylogenetic relationship of four root lesion nematodes(Nematoda: Pratylenchidae)
文献类型:期刊文章
DU Yu;DENG Zong?han;DING Yuan?ming;LIU Bing?yang;LI Min;LEI Qu?wen;LIN Meng(Inspection and Quarantine Technical Center of Yunnan Entry?Exit Inspection and Quarantine Bureau,Kunming 650228,China;Xishuangbanna Customs,Jinghong 666100,China)
机构地区:[1]云南出入境检验检疫局检验检疫技术中心,昆明650228 [2]西双版纳海关,景洪666100
基 金:海关总署应急科研项目(2018IK055).
年 份:2020
卷 号:50
期 号:1
起止页码:28-39
语 种:中文
收录情况:BDHX、BDHX2017、CAB、CAS、CSCD、CSCD2019_2020、JST、RCCSE、WOS、ZGKJHX、ZR、核心刊
摘 要:采用形态学和分子生物学方法对来自荷兰的藏橐吾和铃兰、泰国的高山榕、缅甸的香蕉等种苗(球)分别鉴定出玻利维亚短体线虫Pratylenchus bolivianus、铃兰短体线虫P.convallariae、咖啡短体线虫P.coffeae和斯佩奇短体线虫P.speijeri。对这4种线虫的形态特征进行较为详细的描述后,认为头环、口针、侧区、生殖系统和尾形等形态特征是种类鉴定的重要依据;进一步利用引物28S-D2A/28S-D3Br扩增测序得到上述4种线虫的28S rRNA基因D2/D3区序列,序列分析发现玻利维亚短体线虫从欧洲到美洲的不同种群之间的遗传距离变异较小,仅为0~0.007;铃兰短体线虫同一种群不同个体之间的遗传变异较大,为0.006~0.029;咖啡短体线虫不同种群之间的平均遗传距离为0.013;斯佩奇短体线虫不同种群之间的平均遗传距离为0.010;咖啡短体线虫P.coffeae和斯佩奇短体线虫P.speijeri亲缘关系很近,二者种间平均遗传距离仅为0.026。本研究再次证明线虫28S rRNA基因D2/D3区基因序列可作为短体线虫种间鉴定的依据。
关 键 词:短体线虫 形态特征 28S rRNA 系统进化树 鉴定
分 类 号:S41-32]
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